More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3213 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  96.08 
 
 		 383 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 383 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 904 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 440 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.7 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.42 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.47 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  25.47 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  25.94 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  25.33 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  25.33 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.46 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  25.74 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  25.74 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 425 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.76 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 536 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 360 aa  89.7  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  23.96 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  29.11 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  26.03 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.62 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.27 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  29.45 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.15 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.15 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.15 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 770 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  29.8 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 810 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.49 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>