More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3139 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 400 aa  809    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  93.5 
 
 		 400 aa  733    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  96 
 
 		 411 aa  773    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  83.75 
 
 		 400 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  60.1 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  50.88 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  50.5 
 
 		 404 aa  359  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  48.99 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  49.37 
 
 		 405 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  48.74 
 
 		 405 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  48.48 
 
 		 407 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 414 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 411 aa  235  8e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.66 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.85 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  30.64 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  31.4 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.26 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.26 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  29.72 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.99 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.72 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.99 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.27 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.27 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  29.51 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.17 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.22 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.38 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.22 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.51 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  23.67 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 		 350 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  28.05 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 		 360 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 403 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 394 aa  93.6  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 395 aa  93.6  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  40.32 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  25.12 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.42 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 904 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 367 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  35.52 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 800 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  38.41 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  40.94 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 		 773 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>