More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0058 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 366 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  49.04 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.3 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.36 
 
 		 365 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.29 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.75 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  33.23 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  40.19 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  41.77 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 		 768 aa  96.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  43.01 
 
 		 739 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 414 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 		 750 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 368 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 704 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  41.08 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  33.9 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.45 
 
 		 935 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.44 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4457  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  39.77 
 
 		 426 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 417 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  32.13 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 904 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 433 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.14 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  39.86 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  38.42 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.85 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  38.15 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  25.76 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  32.25 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>