More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3400 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  100 
 
 		 403 aa  801    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 		 410 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.39 
 
 		 407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  40.24 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.98 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 422 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 410 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 452 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.9 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.17 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  31.08 
 
 		 452 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.95 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.95 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.66 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.52 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.67 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.43 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.61 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.52 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.64 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.61 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.12 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  33.1 
 
 		 443 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.88 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  35.43 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.57 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  26.56 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 413 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 904 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.43 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 359 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  30.38 
 
 		 654 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  21.84 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 473 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 394 aa  89.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 1302 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 404 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 353 aa  86.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  38.32 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>