More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  100 
 
 		 404 aa  799    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  74.51 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  71.36 
 
 		 404 aa  578  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  78.05 
 
 		 409 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  73.33 
 
 		 409 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  67.59 
 
 		 404 aa  531  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  67.84 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  64.25 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  64.32 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  67.33 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  59.37 
 
 		 416 aa  481  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  59.95 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  60.4 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  61.25 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  57.86 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  59.05 
 
 		 384 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  57.5 
 
 		 382 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  57.14 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  57.14 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  59.54 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  56.89 
 
 		 382 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  57.39 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  57 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  55.42 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  56.22 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  57 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  48.64 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  55.56 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  49.51 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  52.25 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  42.54 
 
 		 388 aa  323  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  45.39 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 390 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 536 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 405 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 		 439 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.93 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.91 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.29 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.79 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.59 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 435 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  32.21 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.31 
 
 		 423 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 748 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 396 aa  99.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  30.7 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  30.65 
 
 		 458 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>