More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2152 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  100 
 
 		 386 aa  785    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  70.57 
 
 		 395 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  65.28 
 
 		 387 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  66.84 
 
 		 382 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  66.32 
 
 		 382 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  66.32 
 
 		 382 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  65.53 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  64.32 
 
 		 384 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  64.25 
 
 		 387 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  60.78 
 
 		 387 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  60 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  59.85 
 
 		 392 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  58.38 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  57.39 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  55.83 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  61.11 
 
 		 396 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  58.29 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  56.42 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  56.93 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  56.74 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  58.15 
 
 		 411 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  52.67 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  56.68 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  54.44 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  57.88 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  55.01 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  54.94 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  48.91 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  50.25 
 
 		 404 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  46.27 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  43.29 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  44.69 
 
 		 406 aa  322  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 417 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.83 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.7 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 536 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 355 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.5 
 
 		 423 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  29.41 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  30.6 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 437 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 437 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 458 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 672 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.99 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 405 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.32 
 
 		 650 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  29.07 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  28.92 
 
 		 458 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>