More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3427 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
435 aa  850    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  57.01 
 
 
402 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  50.92 
 
 
412 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  50.69 
 
 
412 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  53.08 
 
 
410 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  49.08 
 
 
412 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  50.8 
 
 
412 aa  362  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
399 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
409 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
435 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
414 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
367 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
410 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
394 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
411 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
362 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
408 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
408 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
408 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
358 aa  98.2  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
399 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.74 
 
 
420 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
380 aa  96.7  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  20.96 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.45 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
419 aa  94  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 
365 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.16 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
371 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
356 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
413 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
415 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
382 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
398 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
409 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.94 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
406 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 
353 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 
406 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
399 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.03 
 
 
408 aa  90.5  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
439 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
414 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
423 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.79 
 
 
426 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.71 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
439 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
415 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
413 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.22 
 
 
935 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.3 
 
 
382 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
672 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  26.26 
 
 
416 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  26.96 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3316  glycosyltransferase-like protein  29.5 
 
 
395 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
372 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  33.52 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.2 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
395 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  35.55 
 
 
409 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  29.52 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
417 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  24.55 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  31.03 
 
 
480 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  30.61 
 
 
458 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
365 aa  87  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.03 
 
 
377 aa  87  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
364 aa  86.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.98 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>