More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3316 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3316  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
395 aa  786    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0391  glycosyl transferase, group 1  45.74 
 
 
378 aa  255  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
396 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
426 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
371 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
369 aa  103  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
410 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
362 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
435 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
412 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  23.98 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
394 aa  77  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.83 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.18 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.55 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.26 
 
 
935 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.23 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.5 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  21.56 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  21.03 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
820 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1523  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
626 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
816 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.22 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
390 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  21.67 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  25.4 
 
 
816 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  28.21 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  31.45 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  28.36 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
810 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
871 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  24.51 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  24.51 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
427 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>