More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5134 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
386 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  34.61 
 
 
389 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  29.81 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
380 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  26.18 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
376 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6700  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  30.55 
 
 
389 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
366 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  29.18 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1686  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  26.52 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2420  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
426 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  23.64 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.69 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.33 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1293  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.13 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  24.75 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  24.92 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  24.2 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.5 
 
 
769 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  31.87 
 
 
803 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
743 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  32.35 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
385 aa  67  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
476 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  27.37 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
770 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  22.52 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
536 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
812 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1722  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.664722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.99 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
364 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  28.96 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
433 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.59 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
395 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
386 aa  63.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
446 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>