More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3765 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3765  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 373 aa  758    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1074  putative glycosyl transferase, group 1  54.05 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  36.64 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  28.67 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0645  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.924062 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  32.63 
 
 		 372 aa  89.7  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  32.63 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 		 401 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  28.62 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 		 364 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.52 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.19 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  26.94 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  26.91 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.11 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.91 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  26.59 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 838 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.52 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  24 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 1243 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.29 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  28.14 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 1089 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1232 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4280  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.893245  hitchhiker  0.00115946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3536  glycosyl transferase, group 1 family protein PslI  32.89 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1590  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0531102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  27.87 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>