More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3536 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3536  glycosyl transferase, group 1 family protein PslI  100 
 
 		 366 aa  745    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3308  glycosyl transferase, group 1  88.25 
 
 		 366 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000927937  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4280  glycosyl transferase, group 1  57.1 
 
 		 367 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.893245  hitchhiker  0.00115946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35640  putative transferase  55.98 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000661418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3002  putative transferase  55.71 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0657351  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  29.64 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  28.62 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  28.62 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  34.53 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  29.57 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  29.95 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  29.28 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.28 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  32.88 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  27.33 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  31 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 371 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.85 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.45 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3765  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 2490 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.11 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1074  putative glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  26.32 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13921  putative glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.69221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>