More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3308 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3536  glycosyl transferase, group 1 family protein PslI  88.25 
 
 		 366 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3308  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 366 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000927937  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4280  glycosyl transferase, group 1  56.28 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.893245  hitchhiker  0.00115946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35640  putative transferase  55.19 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000661418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3002  putative transferase  55.19 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0657351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  25.97 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  25.97 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.66 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  32.78 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  32.74 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  29.73 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  28.88 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13921  putative glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.69221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  29.59 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 2490 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  28.45 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.63 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  28.79 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.84 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 1666 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0743  glycosyl transferase group 1  40.18 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0554251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1074  putative glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  23.89 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3765  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.41 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 831 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1232 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>