More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0743 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0743  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
354 aa  665    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0554251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
364 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.07 
 
 
374 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
377 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.58 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
398 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
366 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
362 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
382 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.36 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 
431 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 
381 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 
354 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
371 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  39.56 
 
 
363 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
374 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
380 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
395 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
371 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
376 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  35.33 
 
 
379 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
417 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.55 
 
 
372 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.55 
 
 
372 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
343 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  33.44 
 
 
375 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
376 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
378 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.44 
 
 
375 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.34 
 
 
381 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.82 
 
 
380 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
340 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
359 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  23.33 
 
 
375 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  23.05 
 
 
375 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
434 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  35.35 
 
 
412 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
361 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
360 aa  94  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
437 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
435 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
386 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 
471 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
369 aa  92.8  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
442 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
358 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
376 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
386 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
382 aa  90.1  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
389 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.39 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  31.39 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.39 
 
 
414 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
365 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
361 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.39 
 
 
414 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.39 
 
 
401 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.39 
 
 
414 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.39 
 
 
414 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
1089 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>