More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3002 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_35640  putative transferase  97.28 
 
 		 367 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000661418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3002  putative transferase  100 
 
 		 367 aa  734    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0657351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3308  glycosyl transferase, group 1  55.19 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000927937  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4280  glycosyl transferase, group 1  60.38 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.893245  hitchhiker  0.00115946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3536  glycosyl transferase, group 1 family protein PslI  55.71 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  30.82 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.4 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 		 382 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 384 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.4 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.57 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  45.14 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13921  putative glycosyl transferase, group 1  22.69 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.69221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.7 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.46 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0645  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.924062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  29.23 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 1666 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  34.35 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  24.9 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  28.74 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1074  putative glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  31.79 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>