More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4280 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4280  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 367 aa  731    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.893245  hitchhiker  0.00115946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3536  glycosyl transferase, group 1 family protein PslI  57.1 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35640  putative transferase  61.48 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000661418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3308  glycosyl transferase, group 1  56.28 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000927937  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3002  putative transferase  60.38 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0657351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  30.4 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  32.24 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 370 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  27.54 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  32.22 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  27.8 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.64 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  31 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  31 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  31 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  31 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  31.1 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  30.26 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.26 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.26 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  26.98 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.98 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  31.13 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  30.3 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  29.05 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  39.47 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  30.49 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  25.47 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>