More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0354 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
402 aa  818    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  49.36 
 
 
392 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
382 aa  235  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 
411 aa  226  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  29.9 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
384 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
384 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
390 aa  143  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.21 
 
 
388 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
393 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
419 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
391 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  29.2 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
393 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
399 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
396 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
413 aa  123  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
369 aa  122  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  26.49 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.56 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  26.41 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.56 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  25.06 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
410 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
536 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
391 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
391 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
400 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  29.29 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  23.8 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
378 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
394 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
394 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
385 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
395 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
377 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.19 
 
 
404 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
399 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  35.53 
 
 
351 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.33 
 
 
401 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
424 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
422 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
397 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
387 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
435 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
413 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
375 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
376 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  26.15 
 
 
395 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
348 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
414 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 
406 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
379 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
376 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  22.61 
 
 
382 aa  100  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
385 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.01 
 
 
396 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
396 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
402 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
396 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
353 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.52 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  25.95 
 
 
418 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
417 aa  96.3  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
435 aa  96.3  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.81 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  21.38 
 
 
435 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
820 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25.56 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
384 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>