More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  100 
 
 		 564 aa  1107    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  48.73 
 
 		 575 aa  326  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  49.29 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  46.15 
 
 		 569 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  44.55 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  39.63 
 
 		 603 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  39.46 
 
 		 401 aa  240  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  42.98 
 
 		 573 aa  233  6e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  37.62 
 
 		 1188 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 		 411 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  32.19 
 
 		 723 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 		 402 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 416 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 405 aa  182  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 396 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 		 768 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.7 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.59 
 
 		 371 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 475 aa  99.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 418 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 412 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 378 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 535 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  25.55 
 
 		 650 aa  94  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 415 aa  93.6  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 395 aa  91.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  27.83 
 
 		 414 aa  90.9  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 414 aa  90.9  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 386 aa  90.5  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 365 aa  90.5  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 394 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.74 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 403 aa  87.8  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 		 377 aa  87.4  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 393 aa  87.4  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 384 aa  87.4  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 403 aa  87.4  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 407 aa  87  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  27.16 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.98 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.56 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  28.03 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.06 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  31.43 
 
 		 654 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.49 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  25.41 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.32 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  29.07 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  19.86 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  20.9 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>