More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0161 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  75.18 
 
 
569 aa  815    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  100 
 
 
557 aa  1108    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  50.63 
 
 
575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  44.55 
 
 
564 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  40.66 
 
 
603 aa  286  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  38.94 
 
 
1188 aa  262  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  42.47 
 
 
601 aa  253  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  40.72 
 
 
573 aa  243  7e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  36.57 
 
 
406 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  36.48 
 
 
405 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
405 aa  200  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
405 aa  199  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
405 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  31.87 
 
 
723 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
416 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
406 aa  190  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
411 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
401 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
402 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
401 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
768 aa  131  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
396 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
535 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
434 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  29.17 
 
 
416 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.55 
 
 
414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
412 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.42 
 
 
400 aa  113  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
390 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
390 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
402 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
374 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
394 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 
419 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
386 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
420 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
417 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
426 aa  103  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
409 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
433 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
392 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
393 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
394 aa  97.8  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  29.02 
 
 
404 aa  97.4  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
377 aa  96.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
399 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
404 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
430 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
414 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
441 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
393 aa  94.7  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
408 aa  93.6  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
391 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
409 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
390 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
399 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 
377 aa  91.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
378 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
388 aa  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.86 
 
 
404 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.53 
 
 
394 aa  90.9  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
394 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
409 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
360 aa  90.1  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.87 
 
 
401 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
355 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
409 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
387 aa  89.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
374 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
380 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
390 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
401 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
391 aa  88.6  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  22.83 
 
 
745 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.53 
 
 
473 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.53 
 
 
473 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
401 aa  87.8  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
348 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.05 
 
 
745 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
377 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
407 aa  87.8  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.03 
 
 
392 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
365 aa  87.4  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.46 
 
 
351 aa  87  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
389 aa  87  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
904 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
379 aa  87  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
350 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
361 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.1 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  31.44 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>