More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2394 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
395 aa  820    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  29.18 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.57 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28 
 
 
394 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
415 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
386 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
403 aa  92.8  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  27.59 
 
 
564 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  26.8 
 
 
723 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.44 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  28.11 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  26.67 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1099  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.38 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.89 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.89 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
904 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1563  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
743 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2857  group 1 glycosyl transferase  29.05 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
475 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4413  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  26.24 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4476  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.77 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  25.68 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.5 
 
 
557 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  25.94 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>