More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0348 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
396 aa  807    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
380 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.13 
 
 
394 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.86 
 
 
416 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
406 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.51 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.12 
 
 
723 aa  87.4  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
405 aa  86.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
517 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
401 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  21.01 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
904 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
575 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.48 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  31.25 
 
 
751 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  33.88 
 
 
754 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
461 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  26.14 
 
 
564 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.56 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  22.42 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  24.9 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3593  hypothetical protein  27.1 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  25.94 
 
 
1293 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  26.37 
 
 
420 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  37.65 
 
 
741 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
396 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.27 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  25.13 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.09 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  26.69 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  24.63 
 
 
573 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
425 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
372 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3783  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
394 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653155  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  25.77 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>