130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0257 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  99.51 
 
 		 411 aa  835    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  100 
 
 		 411 aa  839    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.69 
 
 		 427 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  44.69 
 
 		 427 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.44 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  44.19 
 
 		 477 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  32.48 
 
 		 942 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  31.92 
 
 		 443 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 729 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 728 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 728 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  28 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  28.94 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  28.47 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  30.12 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  28.21 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  28.21 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  24.59 
 
 		 1119 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  28.02 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.52 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  30.06 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 903 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  29.27 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 705 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  30.15 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  32.24 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  29 
 
 		 783 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  26.96 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  26.36 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.24 
 
 		 1293 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  26.37 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  30.13 
 
 		 814 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  26.37 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  22.92 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  28.37 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  25.24 
 
 		 741 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  28.38 
 
 		 751 aa  70.1  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  25.43 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  25.47 
 
 		 723 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  30.09 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  23.79 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  22.42 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.04 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  24.55 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.96 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  21.69 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  24.65 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 904 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  19.5 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  22.28 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 535 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  22.22 
 
 		 573 aa  47.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 		 1177 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  19.43 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>