108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0268 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 477 aa  952    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  98.53 
 
 		 477 aa  937    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.44 
 
 		 411 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  44.44 
 
 		 411 aa  323  6e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.51 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  43.51 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  35.82 
 
 		 942 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  25.28 
 
 		 729 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 728 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 728 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  32.35 
 
 		 388 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  29.26 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  28.22 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  28.22 
 
 		 392 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  27.8 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.07 
 
 		 1119 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  24.24 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  25.74 
 
 		 374 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 392 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 397 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 403 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 903 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  29.81 
 
 		 1293 aa  99  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  27.05 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 397 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  27.1 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 382 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  26.16 
 
 		 319 aa  96.7  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  25.75 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  25.07 
 
 		 814 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  28.94 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 385 aa  94.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  24.01 
 
 		 443 aa  93.6  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  30.3 
 
 		 394 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  23.35 
 
 		 783 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.81 
 
 		 378 aa  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 406 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 422 aa  87.8  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  31.43 
 
 		 376 aa  86.7  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  28.16 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  27.24 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 705 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  22.59 
 
 		 783 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 726 aa  76.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  28.74 
 
 		 741 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  24.23 
 
 		 751 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  24.9 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  29.91 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  24.68 
 
 		 754 aa  67  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  28.44 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  22.55 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  21.77 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.58 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  22.08 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 375 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.9 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  22.7 
 
 		 723 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  19.71 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.25 
 
 		 394 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  23.97 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.81 
 
 		 416 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  21.43 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  22.42 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  20.51 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  22.48 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 373 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1721  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  27.17 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  23.21 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>