87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4021 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  93.19 
 
 		 385 aa  733    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 382 aa  788    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  56.06 
 
 		 1293 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  47.75 
 
 		 814 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  50 
 
 		 376 aa  335  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  49.33 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  45.55 
 
 		 420 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  47.57 
 
 		 783 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  45.86 
 
 		 403 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  46.34 
 
 		 783 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  45.6 
 
 		 394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  47.31 
 
 		 412 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  46.15 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  45.26 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  37.01 
 
 		 443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  29.32 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  25.35 
 
 		 434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.46 
 
 		 1119 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  33.81 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  31.18 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  31.18 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  35.21 
 
 		 741 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 404 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  28.15 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 729 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  31.29 
 
 		 751 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 728 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  26.87 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 728 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.63 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.63 
 
 		 477 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  26.54 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  28.86 
 
 		 754 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.2 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  29.39 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.2 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.48 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  24.35 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  23.48 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 903 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 705 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  28.46 
 
 		 391 aa  86.7  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  28.33 
 
 		 942 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  28.29 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.92 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  30.99 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  29.45 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  33.63 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  34 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 		 396 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  29.08 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  24.62 
 
 		 726 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>