99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3059 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
416 aa  840    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  67.65 
 
 
397 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  55.5 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
390 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  28.89 
 
 
385 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  31.12 
 
 
374 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  39.23 
 
 
392 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  38.97 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  38.21 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  30 
 
 
375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
383 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  31.19 
 
 
420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
398 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
705 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  24.76 
 
 
388 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  32.16 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
422 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  30.82 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  30.06 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  23.89 
 
 
434 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  28.53 
 
 
814 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  29.18 
 
 
751 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  28.43 
 
 
741 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  33.09 
 
 
412 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  30.48 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.52 
 
 
427 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.52 
 
 
427 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  29.32 
 
 
1293 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  28.38 
 
 
783 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  27.95 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 
477 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  28.97 
 
 
783 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  30.2 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.37 
 
 
477 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
395 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
411 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.19 
 
 
411 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  32.2 
 
 
407 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  29.16 
 
 
754 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  31.2 
 
 
1119 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
394 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
400 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
397 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
406 aa  96.3  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.31 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  31.45 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
903 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.69 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
350 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
729 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
404 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  30.22 
 
 
942 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
728 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  33.49 
 
 
728 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  28.34 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  32.31 
 
 
416 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  25.66 
 
 
726 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  30.52 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  27.42 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
378 aa  57  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.42 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
393 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
463 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
904 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  27.06 
 
 
396 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
405 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  22.38 
 
 
417 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3173  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0077  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
475 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  27.75 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
405 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
403 aa  43.5  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  27.53 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>