107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0170 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  818    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  55.38 
 
 
406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  54.24 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
389 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
404 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
383 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  30.3 
 
 
751 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  26.6 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
385 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
397 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  26.23 
 
 
754 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  33.04 
 
 
443 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  27.05 
 
 
741 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  24.94 
 
 
407 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  30.2 
 
 
405 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
385 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  30.45 
 
 
394 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  33.83 
 
 
443 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.26 
 
 
1119 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
403 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
416 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
392 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
422 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.43 
 
 
378 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  29.18 
 
 
814 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  31.13 
 
 
319 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  23.01 
 
 
434 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  29.6 
 
 
783 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 
477 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  29.13 
 
 
370 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  27.5 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.84 
 
 
427 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  36.84 
 
 
427 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.45 
 
 
1293 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  28.38 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
705 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  26.94 
 
 
392 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  27.46 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  29.22 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  25.94 
 
 
375 aa  90.5  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  32.46 
 
 
376 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.88 
 
 
477 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  29.65 
 
 
783 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  34.48 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.48 
 
 
411 aa  87  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
397 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  31.74 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  24.49 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  31.18 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
729 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 
728 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 
728 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  31.74 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  26.34 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  30.26 
 
 
942 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.92 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  29.49 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
903 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  28.07 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  27.03 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
374 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
416 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  20.6 
 
 
380 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
416 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
354 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
414 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  32.74 
 
 
414 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  33.93 
 
 
372 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  25.9 
 
 
726 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  31.4 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  31.03 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
421 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3402  hypothetical protein  29.57 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223516  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0077  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>