100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0258 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  783    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  66.13 
 
 
378 aa  518  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  64.71 
 
 
391 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  60.57 
 
 
388 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  62.67 
 
 
382 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
400 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  27.55 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  33.58 
 
 
392 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.16 
 
 
427 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  32.16 
 
 
427 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  33.21 
 
 
392 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  26.84 
 
 
1293 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
395 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  33.21 
 
 
392 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  27.65 
 
 
814 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  26.26 
 
 
394 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
383 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  26.77 
 
 
394 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
409 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
422 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
406 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  28.25 
 
 
751 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  28.86 
 
 
319 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
394 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  28.68 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  26.1 
 
 
443 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  26.49 
 
 
783 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  28.22 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.24 
 
 
411 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
390 aa  93.2  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.7 
 
 
477 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
350 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  25.7 
 
 
783 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.23 
 
 
477 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  25.41 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  38.52 
 
 
754 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 
705 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.3 
 
 
1119 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  28.57 
 
 
741 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  28.8 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  26.67 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  22.15 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  28.1 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  24.56 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  27.23 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  27.98 
 
 
942 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
729 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
728 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
728 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  27.13 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  26.87 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  32.45 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  28.57 
 
 
416 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  32.46 
 
 
417 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
903 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  25.53 
 
 
723 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  30.88 
 
 
400 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  28.5 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  28.7 
 
 
726 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  31.72 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
904 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
412 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1065  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.912454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3593  hypothetical protein  27.54 
 
 
332 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
389 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.83 
 
 
383 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
396 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
415 aa  43.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 
377 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
410 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>