71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0962 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  30.37 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
383 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  33.13 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  34.1 
 
 
751 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  25.87 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  27.8 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.33 
 
 
319 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6016  hypothetical protein  24.78 
 
 
383 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  26.47 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  35.24 
 
 
417 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
378 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  29.63 
 
 
741 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  27.14 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  26.5 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.1 
 
 
1119 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.55 
 
 
477 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  31.25 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.87 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  29.34 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  25 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.42 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  33.07 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  34.51 
 
 
754 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  32.82 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  21.08 
 
 
477 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  29.17 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
729 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  34.38 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  26.35 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  26.22 
 
 
1293 aa  53.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.22 
 
 
427 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.22 
 
 
427 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  29.77 
 
 
783 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
705 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  27.65 
 
 
416 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  30.53 
 
 
783 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  30.88 
 
 
814 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  30.99 
 
 
396 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  22.29 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  25.67 
 
 
726 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  26.63 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  23.88 
 
 
942 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
728 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
728 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.99 
 
 
407 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>