107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0754 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  67.02 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  67.9 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 385 aa  93.2  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  24.89 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  31.4 
 
 		 1119 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  36.8 
 
 		 751 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 705 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  30.82 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  30.82 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  30.47 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.25 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  25.22 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  21.09 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  31.58 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.05 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  34.68 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  24.53 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  29.44 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  34.58 
 
 		 1293 aa  60.1  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  30.38 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 903 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.73 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 729 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  21.69 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  29.68 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  21.17 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.86 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.86 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 517 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  28.15 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  27.23 
 
 		 783 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  23.58 
 
 		 814 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  27.83 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  38.53 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  25.52 
 
 		 783 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.65 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1846  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  30.81 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 728 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 728 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  34.19 
 
 		 376 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 378 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.43 
 
 		 477 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  21.43 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  27.65 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  31.58 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  22.64 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  35.42 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  31.3 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  20.97 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  19.66 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  28.35 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  36.7 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  26.67 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  32 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  30.51 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  30.34 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>