More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1846 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1846  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 415 aa  867    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1372  glycosyltransferase-like protein  50.51 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219028  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.02 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  31.4 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.16 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5501  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0891  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.48 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.88 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2006  group 1 glycosyl transferase  31.96 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.669637  normal  0.233825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  26.92 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  24.59 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  26.6 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 365 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.26 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05650  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.520529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4454  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.62 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.47 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  26.14 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  26.97 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  22.28 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  28.36 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.21 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  24.91 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 350 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.21 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0293  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283411  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 704 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>