100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3716 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 400 aa  827    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  54.24 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  50.64 
 
 		 406 aa  411  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  27.94 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  35.75 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  26.45 
 
 		 751 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  24.94 
 
 		 754 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  23.96 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.51 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  26.33 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  30.63 
 
 		 741 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  33.48 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  27.74 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 705 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  24.05 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.01 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  27.74 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  27.37 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.01 
 
 		 411 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  26.1 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  28.38 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.85 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  30.94 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  28.24 
 
 		 783 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  31.5 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  28.05 
 
 		 319 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  28.44 
 
 		 394 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  36 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  36 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  38.79 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.76 
 
 		 1119 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  28.5 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  30.26 
 
 		 814 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  25.88 
 
 		 1293 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  27.49 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  24.68 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  27.24 
 
 		 783 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  28.75 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  21.6 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  25.93 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  31.45 
 
 		 942 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  30.64 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30.64 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  25.99 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  26.19 
 
 		 726 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 903 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  25.91 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  28 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  36.47 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 428 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  28.93 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.89 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5122  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 		 550 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5514  group 1 family glycosyl transferase  26.56 
 
 		 550 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  25.11 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5364  hypothetical protein  26.56 
 
 		 714 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  31.55 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4413  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 372 aa  43.1  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>