102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02222 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  780    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  70.67 
 
 
374 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  48.21 
 
 
385 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
390 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  31.5 
 
 
392 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  30.89 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
397 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  31.23 
 
 
392 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
389 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  25.31 
 
 
388 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
705 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  29.97 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
397 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
403 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
385 aa  125  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.16 
 
 
1293 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  32.87 
 
 
814 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  26.79 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  25.88 
 
 
751 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  30.25 
 
 
412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  33.19 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.36 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.94 
 
 
411 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  30.45 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  32.23 
 
 
783 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  32.06 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  27.27 
 
 
754 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  27.32 
 
 
741 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.24 
 
 
477 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  27.07 
 
 
443 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
350 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
382 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.97 
 
 
427 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.97 
 
 
427 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  23.57 
 
 
477 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  22.4 
 
 
434 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
395 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
385 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  29.86 
 
 
783 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
400 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  26.91 
 
 
443 aa  96.3  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  29.55 
 
 
726 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  26.58 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
397 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  32.42 
 
 
729 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.82 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
728 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
728 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
903 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  32.14 
 
 
942 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.27 
 
 
1119 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  27.27 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  30.06 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
395 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  31.5 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  22.89 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  25 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.31 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  28.44 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  22.85 
 
 
400 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
374 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  20.97 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  21 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
398 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.78 
 
 
382 aa  47  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
380 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  22.78 
 
 
723 aa  46.2  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  22.35 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
575 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.55 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
395 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  20.83 
 
 
396 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>