110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1963 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
406 aa  834    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  55.38 
 
 
394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  50.64 
 
 
400 aa  411  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
397 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
383 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  26 
 
 
751 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
398 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.06 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
390 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
385 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  25.94 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.89 
 
 
1119 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
392 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.39 
 
 
378 aa  103  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
422 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  26.83 
 
 
392 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  26.83 
 
 
392 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  24.07 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
388 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  26.29 
 
 
392 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  25.56 
 
 
741 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  31.65 
 
 
443 aa  96.3  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
409 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
416 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  25.83 
 
 
434 aa  96.3  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  23.5 
 
 
754 aa  94.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
390 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
705 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
382 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  26.64 
 
 
420 aa  89.7  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.87 
 
 
477 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  25.38 
 
 
1293 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  27.3 
 
 
394 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.12 
 
 
477 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  23.25 
 
 
374 aa  86.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  25.35 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  25.09 
 
 
783 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  27.27 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  22.78 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  24.3 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  27.35 
 
 
783 aa  79.7  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  28.62 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.44 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.96 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  34.44 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  30.96 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
729 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  26.64 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  26.52 
 
 
814 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  28.19 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  24.78 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  25.78 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
728 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
728 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  21.1 
 
 
416 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
350 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
903 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  24.68 
 
 
400 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  26.74 
 
 
942 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  31.19 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
392 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
373 aa  53.5  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5122  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.09 
 
 
550 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5514  group 1 family glycosyl transferase  28.09 
 
 
550 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5364  hypothetical protein  28.09 
 
 
714 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
402 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
375 aa  51.6  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.49 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
403 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  31.63 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  29.79 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  23.67 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
434 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
403 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0077  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1092  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  30.15 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.57 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  33.33 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3402  hypothetical protein  29.93 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>