99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2899 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  812    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  85.53 
 
 		 394 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  59.13 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  56.28 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  55.65 
 
 		 814 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  55.59 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  51.69 
 
 		 405 aa  381  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  54.42 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  50.83 
 
 		 422 aa  358  8e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  51.37 
 
 		 412 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  52.38 
 
 		 783 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  49.3 
 
 		 783 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  46.8 
 
 		 1293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  45.88 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  46.15 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  38.54 
 
 		 443 aa  242  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  25.41 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  33.56 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  33.58 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  33.58 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  34.15 
 
 		 741 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  34.25 
 
 		 751 aa  137  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 416 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  33.81 
 
 		 754 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  32.88 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  29.49 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  32.06 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.32 
 
 		 1119 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  36.77 
 
 		 705 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 350 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.37 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.06 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  30.06 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  27.88 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  25.99 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.94 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  28.18 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 903 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.47 
 
 		 477 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  25.39 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 409 aa  90.1  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 382 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 728 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 729 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 728 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.56 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  34.56 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  27.38 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  33.58 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  22.43 
 
 		 942 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  35.65 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  26.64 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  29.68 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 726 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  26.35 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 380 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  28.24 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.2 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  25.45 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  25.45 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.32 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.46 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 859 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  29.55 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 904 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3173  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 370 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>