90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2279 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 382 aa  769    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  70.56 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  59.57 
 
 		 378 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  62.67 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  61.73 
 
 		 391 aa  443  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  36.06 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  35.32 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  35.56 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  30.6 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.6 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  26.52 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  31.04 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  28.05 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  31.33 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  24 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  24.38 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  25.63 
 
 		 1293 aa  96.3  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  26.18 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.86 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.62 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.62 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  26.87 
 
 		 814 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  25.91 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.09 
 
 		 1119 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  26.04 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 705 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  28.87 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  31.54 
 
 		 751 aa  83.2  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.49 
 
 		 477 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.98 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  23.19 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  22.96 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  31.08 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  26.01 
 
 		 783 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  25.99 
 
 		 783 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 728 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 728 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  27.1 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  27.38 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  26.58 
 
 		 942 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  23.55 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  31.87 
 
 		 754 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  27.19 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  30.32 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  29.82 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  29.02 
 
 		 726 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  31.78 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  29.2 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  30.45 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 903 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.16 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.97 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.18 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 434 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>