More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3119 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
412 aa  843    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  55.47 
 
 
416 aa  441  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
408 aa  265  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
415 aa  253  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
407 aa  222  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  30.67 
 
 
401 aa  216  7e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
418 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
414 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
420 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  26.41 
 
 
415 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  29.69 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
407 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
418 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
411 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
517 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
408 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
404 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
421 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
405 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.07 
 
 
407 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
410 aa  104  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
405 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  27.41 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
411 aa  97.1  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
422 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
421 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
406 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25.19 
 
 
416 aa  93.6  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.99 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  27.99 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.99 
 
 
413 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  28.06 
 
 
417 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
390 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.43 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  25.68 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
416 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
422 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  22.9 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
405 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.07 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  23.47 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  27.47 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  28.08 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  26.9 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
566 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  25.38 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  24.41 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  22.84 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  24 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.13 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.53 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  20.36 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  19.91 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  28.39 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  22.29 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.54 
 
 
723 aa  67.8  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  18.06 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
392 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
768 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>