102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0677 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
397 aa  798    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  67.65 
 
 
416 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  58.1 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
390 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  38.22 
 
 
392 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  37.96 
 
 
392 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  38.24 
 
 
392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  29.19 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  30.24 
 
 
374 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  29.1 
 
 
375 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
389 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  35.29 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  33.42 
 
 
705 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
383 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
385 aa  149  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
398 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  28.13 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  30.85 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  32.14 
 
 
783 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  33.82 
 
 
814 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  26.67 
 
 
434 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  33.22 
 
 
405 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  34.1 
 
 
394 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  34.09 
 
 
443 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
403 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  30.07 
 
 
751 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  30.84 
 
 
754 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  34.82 
 
 
1293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  30.03 
 
 
741 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  32.06 
 
 
443 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  33.7 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  32.02 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
382 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.34 
 
 
427 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.34 
 
 
427 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
395 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  26.74 
 
 
319 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  36.9 
 
 
729 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
422 aa  103  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.17 
 
 
477 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.17 
 
 
477 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
350 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  30.85 
 
 
370 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  29.02 
 
 
783 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
400 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  31.72 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.84 
 
 
411 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.45 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  29.92 
 
 
1119 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
903 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
728 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
728 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.05 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  32.64 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  26.76 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  29.37 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  30.59 
 
 
942 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  28.66 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  28.43 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  28.05 
 
 
726 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
414 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.74 
 
 
414 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
378 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
475 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  22.55 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  26.84 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
859 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  32 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
904 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  45.76 
 
 
430 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
390 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0077  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  29.46 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>