More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0960 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
430 aa  883    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
415 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  29.51 
 
 
432 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  30.74 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.17 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.07 
 
 
424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  29.07 
 
 
433 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  28.47 
 
 
484 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
463 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
507 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
859 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
517 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
519 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
457 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  29.52 
 
 
861 aa  75.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
540 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
522 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.91 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.58 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  23.31 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  24.9 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
481 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  22.02 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  22.02 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  21.12 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
517 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
419 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
409 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  22.6 
 
 
405 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  24.82 
 
 
382 aa  63.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0594  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730707  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  24.51 
 
 
564 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
516 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
394 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
418 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  25.4 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  23.34 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  24.23 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  21.92 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  21.71 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
575 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  21.52 
 
 
416 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  22.6 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
389 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
566 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  20 
 
 
375 aa  57  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
402 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  20.55 
 
 
401 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
361 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3783  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653155  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 
557 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  21.29 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
475 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
387 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>