151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0594 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0594  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 411 aa  845    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 		 413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0492  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2021  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000675032 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1301  glycosyltransferase-like protein  21.58 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.922127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  20.81 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  29.71 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  24.48 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.1 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  20.98 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  22.47 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25.4 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  31.33 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 		 743 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 566 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  30.3 
 
 		 389 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  20.48 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  28.47 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  22.26 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 476 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  33.09 
 
 		 745 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  19.82 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 374 aa  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  20.36 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.15 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  24.2 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.15 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  21.32 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  26.99 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.23 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.15 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  24.2 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  24.2 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  18.02 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  28.22 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.82 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  24.37 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  27.7 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>