98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3923 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
413 aa  842    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0594  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730707  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0492  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
410 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1301  glycosyltransferase-like protein  26 
 
 
418 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.922127  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2021  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000675032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  22.16 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  20.43 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.51 
 
 
413 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 
413 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 
413 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  22.03 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  24.12 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  23.98 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  20.74 
 
 
517 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  20.73 
 
 
414 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  22.04 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  22.02 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
411 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  20.67 
 
 
407 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  22.74 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  20.46 
 
 
408 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
390 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
392 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
425 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
363 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  23.6 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  22.43 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.29 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  21 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  21.8 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  22.05 
 
 
417 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  28.68 
 
 
416 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0215  glycosyltransferase  36.25 
 
 
379 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 
413 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
410 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
425 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
418 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.56 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  19.21 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  29.31 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3501  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  26.81 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  23.25 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  21.85 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  24.8 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.41 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.52 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1372  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 
402 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192872  hitchhiker  0.00513595 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39314  beta-mannosyltransferase  23.19 
 
 
464 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.246147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.32 
 
 
379 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
418 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
386 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0597  glycosyl transferase, group 1  23.41 
 
 
404 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.287593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  28.7 
 
 
388 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
353 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
398 aa  43.1  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  23.9 
 
 
400 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>