83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3501 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3501  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 418 aa  839    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1372  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192872  hitchhiker  0.00513595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1301  glycosyltransferase-like protein  24.38 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.922127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  22.62 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  21.39 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 753 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1743  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  26.8 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  21.57 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  22.5 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  27.51 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3170  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 375 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 1089 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 376 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2178  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.9 
 
 		 598 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  22.97 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2300  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.9 
 
 		 598 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4036  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212035  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 596 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  18.91 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0528  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.9 
 
 		 598 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.81282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1071  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.9 
 
 		 598 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3282  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.9 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.741817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3402  hypothetical protein  30.73 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223516  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3247  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.9 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  30.25 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3296  WcbH  26.9 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4034  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  25.86 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  24.81 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.84 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  19.29 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  24.03 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 1241 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.06 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3783  glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653155  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.74 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2899  group 1 glycosyl transferase  22.53 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00186189  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 427 aa  43.1  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>