More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3170 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3170  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
375 aa  740    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4034  glycosyl transferase group 1  85.37 
 
 
374 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.16 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.32 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  29.17 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.48 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.65 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.15 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  29.14 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  25.07 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  29.94 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.12 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.94 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
536 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  29.94 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  33.61 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.45 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.03 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.8 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.47 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0054  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.13 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1983  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.43 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
753 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  26.63 
 
 
392 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  29.63 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3245  hypothetical protein  27.52 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.67 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  33.33 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  40.17 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
800 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.76 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  32.53 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.46 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  28.9 
 
 
1219 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  37.19 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
391 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  40.71 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  37.93 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.66 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
310 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  21.69 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
412 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
404 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  36.15 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
424 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
393 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  27.96 
 
 
403 aa  63.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
435 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.71 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  31.71 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>