More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4217 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
418 aa  852    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
407 aa  243  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
415 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
416 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
412 aa  193  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
414 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
408 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  28.85 
 
 
415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  25 
 
 
401 aa  143  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
420 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
517 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  31.51 
 
 
417 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
410 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
412 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  32.15 
 
 
405 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
408 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
407 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
421 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
441 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
414 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
402 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  25.5 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  24.81 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.86 
 
 
404 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  22.64 
 
 
411 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.98 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.46 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  23.04 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.72 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  25.58 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  25.49 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  19.34 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.25 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
408 aa  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.78 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0594  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730707  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  28.77 
 
 
557 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  21.64 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  21.64 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
768 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  23.54 
 
 
475 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
372 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  25.95 
 
 
407 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
412 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>