199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0365 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
404 aa  813    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  46.57 
 
 
398 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  46.08 
 
 
398 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
407 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
415 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
408 aa  146  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
414 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
418 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  29.8 
 
 
401 aa  125  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
412 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  24.53 
 
 
417 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  28.13 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
403 aa  106  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
405 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
421 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
412 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  21.05 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.12 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
402 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  21 
 
 
407 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  22.57 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  25.24 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  24.07 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
436 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  21.61 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  19.06 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  23.44 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  23.01 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0594  glycosyl transferase group 1  20.81 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730707  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.12 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  20.73 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.05 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  24.05 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.35 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  26.08 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  21.25 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
419 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  20.5 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  19.95 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  21.14 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  19.33 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  20.42 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  21.36 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  20.9 
 
 
475 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  20.64 
 
 
416 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  19.2 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  22.65 
 
 
401 aa  59.7  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
566 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0792  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.416249  hitchhiker  0.00203694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  20.82 
 
 
413 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  19.82 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  22.33 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  21.27 
 
 
442 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 
390 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  23.53 
 
 
723 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  19.93 
 
 
405 aa  56.6  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  18.51 
 
 
452 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
379 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  19.46 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0297  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  18.95 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  20.32 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  21.36 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  19.84 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  21.36 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  23.72 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
406 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  20.78 
 
 
388 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  20.82 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>