156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0166 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  91.46 
 
 
398 aa  750    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
398 aa  812    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  46.57 
 
 
404 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
415 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
407 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
412 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
414 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
416 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
418 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  27.09 
 
 
401 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
420 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
405 aa  99.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
421 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  26.84 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
517 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
407 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  23.2 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.27 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.59 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.59 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.29 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
413 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  23.38 
 
 
408 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.31 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  23.14 
 
 
396 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
418 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
422 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  23.74 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.15 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.2 
 
 
396 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  25.16 
 
 
723 aa  56.2  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2193  glycosyl transferase group 1  20.77 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0310577  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  23.45 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  22.76 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4756  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493707  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.3 
 
 
394 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  21.99 
 
 
417 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0061  glycosyltransferase  27.03 
 
 
411 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.715924  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
415 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
416 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  20.88 
 
 
410 aa  52.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.85 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
361 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
406 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
379 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  20.71 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
406 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  21.15 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  21.15 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  21.15 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
398 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  21.32 
 
 
407 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  22.43 
 
 
373 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  21.15 
 
 
407 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  21.09 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0594  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730707  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  22.29 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.62 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.08 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.47 
 
 
346 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  20.31 
 
 
475 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>