21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  739    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  40.81 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  22.07 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  28.16 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 		 517 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 540 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 463 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  30 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>