28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  760    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  40.81 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  24.31 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  24.31 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  24.91 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2760  hypothetical protein  30.08 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 463 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 517 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 540 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  39.18 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 522 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7632  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  31.9 
 
 		 484 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 447 aa  46.2  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  23.25 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  25.34 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 425 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>