235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1691 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  90.19 
 
 		 540 aa  907    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 550 aa  1090    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  60.44 
 
 		 517 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  58.05 
 
 		 519 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  64.64 
 
 		 447 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  39.03 
 
 		 516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  37.77 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 		 518 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 		 859 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 		 545 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  36.67 
 
 		 861 aa  188  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  34.41 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.06 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.06 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  22 
 
 		 424 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  22.44 
 
 		 433 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 386 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  27.48 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  32.59 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 378 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 403 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  22.64 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  22.13 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.32 
 
 		 374 aa  57  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  23.23 
 
 		 393 aa  57  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 406 aa  57  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  20.19 
 
 		 366 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  22.31 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 372 aa  55.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 375 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 361 aa  54.3  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  26.25 
 
 		 377 aa  54.3  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 369 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 399 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 390 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 393 aa  53.5  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  22.89 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  26.82 
 
 		 399 aa  53.5  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 385 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 388 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 403 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  20.39 
 
 		 419 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.67 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 475 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  27.59 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  27.74 
 
 		 564 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.28 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 358 aa  51.6  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 378 aa  51.2  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 419 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 383 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.41 
 
 		 489 aa  51.2  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 411 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 375 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 411 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  27.27 
 
 		 387 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  29.25 
 
 		 357 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 372 aa  50.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 		 393 aa  50.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  21.74 
 
 		 394 aa  50.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 372 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.28 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>