More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2179 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 388 aa  773    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1288  glycosyl transferase group 1  75.6 
 
 		 385 aa  545  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.376633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  43.36 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  44.56 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1139  hypothetical protein  30.35 
 
 		 384 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0885  a-glycosyltransferase  24.88 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00174495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  21.19 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.48 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1682  hypothetical protein  25.38 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  23.96 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  25.37 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  20.5 
 
 		 797 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  29.69 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 761 aa  70.1  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.96 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 774 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  26.54 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  20.67 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 763 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  26.35 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 767 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.1 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.77 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  24.78 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  27 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  21.86 
 
 		 756 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.91 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.64 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.99 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  22.19 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.9 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.09 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  31.37 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.15 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 800 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.23 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  20.72 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  24 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2890  glycosyltransferase-like protein  28.71 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  20.34 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>