50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1139 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1139  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  761    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0885  a-glycosyltransferase  24.94 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00174495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1288  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.376633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5872  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.988118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.27 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1331  hypothetical protein  21.16 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.823178  normal  0.713454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  20.85 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3252  hypothetical protein  27.49 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.44 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.57 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.86 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4954  hypothetical protein  22.22 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  21.07 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.81 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.58 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  22.01 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1104  hypothetical protein  24.47 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>