14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1331 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  730    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.823178  normal  0.713454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1682  hypothetical protein  31.8 
 
 		 331 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  20.91 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0885  a-glycosyltransferase  30.6 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00174495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4954  hypothetical protein  27.23 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1719  hypothetical protein  24.19 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.570505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1288  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.376633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1104  hypothetical protein  23.46 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1139  hypothetical protein  21.16 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>